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scRNA-seq 9 阶段实战手册
scRNA-seq 9 阶段实战手册
从原始矩阵到细胞通讯,Python(scanpy) + R(Seurat) 双栈对照
基本信息
| 名称(name) | scRNA-seq 9 阶段实战手册 |
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| 副标题(subtitle) | 从原始矩阵到细胞通讯,Python(scanpy) + R(Seurat) 双栈对照 |
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| 简介(displayDescription) | 想学单细胞分析,教程要么只有零散代码、要么只给结论不给中间数字,跟着跑一遍还是不知道每一步该看什么。这个案例生成一份 9 阶段完整实战手册:数据读入、QC、标准化+HVG+PCA、聚类+UMAP、细胞注释、批次整合(Harmony)、差异分析、拟时序、细胞通讯(CellChat),每节固定「引言 + Python 代码 + R 等效提示 + 关键结果数值表 + 结果图」五段式,11 张结果图全部内嵌,单文件自包含、复制到任何浏览器即可查看。适合:单细胞入门研究生、生信培训讲师、搭建分析 SOP 的团队、方案验证与选型对比的分析师。 |
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| 分类(categories) | 数据分析知识与学习 |
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| 标签(tags) | scRNA-seqscanpyHarmony拟时序细胞通讯 |
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| 累计使用人次 | 0 |
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| 版本(version) | 1.0 |
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| 产物类型(artifact_type) | html |
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| 引用的专家 | 单细胞转录组分析专家 |
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每日记录
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| 日期 | 累计使用人次 | 日增 |
| 2026-09-23 |
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