Stereo-seq 空间转录组分析手册

做空间转录组分析最头疼的是流程割裂：上游投递在 DCS 平台、下游分析换 Stereopy、细胞分割又得学 Spateo，网上没有一份把 7 个场景串起来的中文手册。这个案例生成一份覆盖 SAW-ST-V8 上游主分析、Stereopy 标准下游、多样本整合（Harmony）、Spateo 细胞分割、连续切片 3D 重建、CCI 细胞通讯、SCC 结构数字化 7 大场景的完整手册：每个场景都有目标说明、可运行代码、产出文件清单、结果图和解读要点，11 张图全部内嵌，单文件自包含可直接当团队培训材料。适合：Stereo-seq 平台用户、空间组学方向研究生、搭建空间转录组 SOP 的团队、DCS 云平台任务投递者。